На основе Постановления правительства Республики Казахстан №84 от 11 февраля 2010 года «О некоторых вопросах республиканских государственных казенных предприятиях Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан» и приказа Комитета наук министерства образования и науки Республики Казахстан №35 от 1 июня 2010 июня года «О создании «Музея науки» республиканского государственного предприятия на праве хозяйственноговедения «Ғылым ордасы» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан» было принято решение о создании Музея истории казахстанкой науки.
Музей является одним из первых учереждении, рассказывающий об истории становлении и развития отчественной науки, созданное с целью изучения и популяризации многолетней истории науки нашего государства.