Органом Предприятия является его генеральный директор, а также наблюдательный совет. В своей деятельности Наблюдательный совет руководствуется действующим законодательством Республики Казахстан, Уставом Предприятия, Положением о наблюдательном совете и иными нормативными правовыми актами. Число членов Наблюдательного совета должно быть нечетным и составлять не менее пяти человек, не находящихся в отношениях близкого родства и свойства друг с другом и руководителем Предприятия. Члены Наблюдательного совета не входят в штат работников Предприятия. Не менее тридцати процентов состава наблюдательного совета Предприятия являются независимыми членами наблюдательного совета.

В состав Наблюдательного совета входит представитель уполномоченного органа в области науки - Комитета науки Министерства науки и высшего образования Республики Казахстан (далее - уполномоченный орган), соответствующий требованиям, предъявляемым к лицам, избираемым в состав наблюдательного совета в государственных предприятиях на праве хозяйственного ведения, утвержденных, и лица, избираемые на конкурсной основе. Требования, предъявляемые к лицам, избираемым в состав Наблюдательного совета, а также порядок конкурсного отбора членов Наблюдательного совета и досрочного прекращения их полномочий утверждаются уполномоченным органом по государственному планированию в соответствии с действующим законодательством Республики Казахстан.